Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Vmn1r238E9Q373 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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