Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lrp3E9Q1T6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lrp3E9Q1T6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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Lrp3E9Q1T6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Lrp3E9Q1T6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Lrp3E9Q1T6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Lrp3E9Q1T6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Lrp3E9Q1T6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Lrp3E9Q1T6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Lrp3E9Q1T6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Lrp3E9Q1T6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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