Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Srp54bE9PXC0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Srp54bE9PXC0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms