Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Vpreb3D3Z6J4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms