Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc8D3YZV8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 153.8 ms