Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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BC048679D3YXE9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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BC048679D3YXE9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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BC048679D3YXE9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
BC048679D3YXE9 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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BC048679D3YXE9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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BC048679D3YXE9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC048679D3YXE9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC048679D3YXE9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC048679D3YXE9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC048679D3YXE9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
BC048679D3YXE9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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BC048679D3YXE9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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