Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm436B1AVU6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm436B1AVU6 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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