Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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H2-M5A7VMS3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
H2-M5A7VMS3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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