Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Atp8b5A3FIN4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp8b5A3FIN4 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Atp8b5A3FIN4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Atp8b5A3FIN4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Atp8b5A3FIN4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Atp8b5A3FIN4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Atp8b5A3FIN4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Atp8b5A3FIN4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atp8b5A3FIN4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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