Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms