Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprfA2A8L5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprfA2A8L5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms