Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdc27A2A6Q5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdc27A2A6Q5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdc27A2A6Q5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cdc27A2A6Q5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms