Protein–RNA interactions for Protein: A2A699

Fam171a2, Protein FAM171A2, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171a2A2A699 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam171a2A2A699 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms