Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms