Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn2r25W4VSP2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms