Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ap3b1Q9Z1T1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3b1Q9Z1T1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms