Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PapolbQ9WVP6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms