Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUQ2

Preb, Prolactin regulatory element-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrebQ9WUQ2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PrebQ9WUQ2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms