Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Psma4Q9R1P0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Psma4Q9R1P0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms