Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Copg1Q9QZE5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Copg1Q9QZE5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms