Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Six6Q9QZ28 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Six6Q9QZ28 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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