Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME5

Ap3b2, AP-3 complex subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b2Q9JME5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ap3b2Q9JME5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ap3b2Q9JME5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms