Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Upk3aQ9JKX8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Upk3aQ9JKX8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Upk3aQ9JKX8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Upk3aQ9JKX8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Upk3aQ9JKX8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Upk3aQ9JKX8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Upk3aQ9JKX8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Upk3aQ9JKX8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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