Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Arl6ip1Q9JKW0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms