Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ldb3Q9JKS4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms