Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Irx5Q9JKQ4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms