Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Tmod2Q9JKK7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmod2Q9JKK7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Tmod2Q9JKK7 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Tmod2Q9JKK7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Tmod2Q9JKK7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Tmod2Q9JKK7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmod2Q9JKK7 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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