Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MesdQ9ERE7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
MesdQ9ERE7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms