Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpne8Q9DC53 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpne8Q9DC53 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms