Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms