Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sgf29Q9DA08 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms