Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifrd2Q9D8U0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms