Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cldn22Q9D7U6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn22Q9D7U6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms