Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J4

Necab3, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab3Q9D6J4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Necab3Q9D6J4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Necab3Q9D6J4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms