Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx29Q9D3S3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms