Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Hddc3Q9D114 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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