Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gtf2e1Q9D0D5 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms