Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PompQ9CQT5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms