Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Nicn1Q9CQM0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms