Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Commd4Q9CQ02 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Commd4Q9CQ02 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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