Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Atg3Q9CPX6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms