Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nsmce3Q9CPR8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms