Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SHANK3Q9BYB0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHANK3Q9BYB0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms