Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gtf2a1Q99PM3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms