Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NsmfQ99NF2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms