Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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Hdac9Q99N13 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Hdac9Q99N13 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Hdac9Q99N13 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Hdac9Q99N13 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdac9Q99N13 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Hdac9Q99N13 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Hdac9Q99N13 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Hdac9Q99N13 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Hdac9Q99N13 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Hdac9Q99N13 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Hdac9Q99N13 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Hdac9Q99N13 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
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Hdac9Q99N13 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Hdac9Q99N13 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
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Hdac9Q99N13 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hdac9Q99N13 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms