Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SrrtQ99MR6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SrrtQ99MR6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms