Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Abcf2Q99LE6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms