Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnf34Q99KR6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms