Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
GatbQ99JT1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
GatbQ99JT1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms